la carte des protéines.

Mise à jour, 17 juin 2015

Des scientifiques de l’université de Toronto ont enregistré, avec un niveau de détail sans précédent, les emplacements de toutes les protéines dans une cellule. Cette nouvelle carte de la protéine permet aux scientifiques de savoir ce qui se passe dans une cellule lorsque la maladie frappe, et aidera également aider à trouver de meilleurs traitements.

Dirigée par les professeurs Brenda Andrews, Charles Boone, et Jason Moffat de l’Université de Donnelly Centre de Toronto, l’équipe a construit un processus de surveillance automatisé de pointe pour surveiller où les protéines se trouvent dans la cellule et voir comment elles se déplacent en réponse à des perturbations génétiques ou environnementales.

La base de données détaillée des emplacements de protéines sera disponible, également ce mois-ci, à travers G3 : Genes | Génomes | Génétique, la revue officielle de la Genetics Society of America, afin que soit accessible à tout le monde l’emplacement et le mouvement des protéines qui les intéressent.

Pendant que les cellules font leur travail, telles que la fabrication, la maintenance et la réparation du corps, elles déplacent en permanence les protéines. Mais les scientifiques savent peu de choses sur la façon dont cette circulation se passe dans les cellules. Ceci est sur le point de changer à mesure que la nouvelle carte qui dresse un graphique du mouvement des protéines et de leur abondance, devient disponible. Cette nouvelle carte des protéines aidera les scientifiques à mieux comprendre ce qui se passe dans les cellules quand ils sont en bonne santé et ce qui va mal en cas de maladie.

Les protéines sont produites par les gènes et sont responsables de tous les rouages de la cellule.
Pour visualiser et compter la plupart des protéines- environ 6000 dans la cellule, les chercheurs ont recueilli des données pour 20 millions de cellules. Depuis plus de dix ans, les scientifiques ont travaillé en étroite collaboration avec des ingénieurs en robotique, qui ont construit des machines pour traiter les cellules, et des concepteurs de logiciels qui ont créé des algorithmes basés sur l’intelligence artificielle pour traiter la grande quantité de données.

Le Pr Andrews et son équipe ont utilisé la levure de boulanger comme modèle pour comprendre la biologie de la cellule humaine.
Les cellules de levure fonctionnent de manière très similaire aux cellules humaines, mais ont moins de protéines, environ un quart de ce que l’on trouve dans les cellules humaines, plus complexes. Cette relative simplicité a permis aux chercheurs comme Andrews et Boone d’utiliser la levure de faire de nombreuses découvertes fondamentales sur la façon dont les cellules de levure et les cellules humaines fonctionnent.

Leur équipe non seulement retracé le mouvement des protéines et leur abondance dans les cellules normales, mais ils a aussi regardé ce qui se passe lorsque les cellules sont porteuses d’une mutation, qui peut conduire à une maladie génétique, par exemple, ou quand elles sont exposées à différents médicaments.

Ensuite, les chercheurs utiliseront cet outil puissant pour étudier comment les protéines se déplacent dans les cellules humaines, telles que les cellules cancéreuses, afin de mieux comprendre l’origine de la maladie, mais aussi aider à la recherche de nouveaux traitements.

(July 15, 2008) — In an Australian first, scientists at Sydney's Centenary Institute have mapped the anatomy of a membrane protein. This exciting discovery has the potential to change the way new drugs are discovered and reduce the development time for new treatments.

Les scientifiques ont fait la carte d'une membrane de protéine. Cette découverte est très encourageante et a le potentiel de changer la manière dont les nouveaux médicaments sont découverts et de réduire le temps de développement de ces médicaments.

"These membrane proteins are the target for 70% of all therapeutic drugs so an increased understanding of them is vital for future drug discoveries," said Centenary Institute Executive Director, Professor Mathew Vadas.

Ces membranes de protéine sont la cible pour 70% des médicaments aussi les comprendre mieux est vital pour découvrir de nouveaux médicaments.

Publishing this month in the journal, Nature Structural & Molecular Biology, Dr Mika Jormakka and his colleagues at UNSW, say understanding membrane protein structures will help develop better treatments for some of Australia's biggest killers such as cancer.

Cela peut aider à développer des médicaments contre le cancer.

Dr Jormakka explains: "The best way to imagine the way we currently discover new drugs is to think of a lock and key. The lock is the membrane protein that causes the body to respond to treatment and the key is the drug."

La meilleure manière d'imager la chose c'est de penser à une clef et à une serrure, la membrane de la protéine étant la serrure et le médicament la clef.

"Up until recently we have never known what the lock looked like so we have to build thousands of keys (drugs) until we stumble upon one that fits. By mapping membrane proteins we are creating a map of the locks -- this should make it much easier to design a key that fits."

Jusqu'à maintenant nous ne savions pas comment la serrure était faite aussi nous produisions des milliers de clés (les médicaments) jusqu'à ce que nous en trouvions une qui faisait l'affaire. en cartographiant cette membrane de protéine cela rendra beaucoup plus facile de faire une clef qui marchera.

Work on membrane proteins is still in its infancy, particularly in Australia. Having joined the Centenary Institute last year to head up the new Structural Biology laboratory, Dr Jormakka is widely recognised as a leader in the field.

Travailler sur les protéines est encore une science jeune.

"It is an exciting time to be working in structural biology as we are still very much at the start of the story," he explains. "There are only around 70 membrane proteins out of a potential 10,000 that have ever been mapped."

70 cartes de protéines sont faires sur 10,000 à faire.

"At Centenary, we are now trying to map membrane proteins that are involved in 'pumping' drugs out of cells thereby reducing the effectiveness of cancer chemotherapy agents and antibiotics among other drugs."

Nous essayons de cartographier la membrane de protéine qui pompe les médicaments hors de la cellule et rend les médicaments anti-cancer moins efficaces.

"By understanding how these membrane proteins work, we have the potential to eliminate the trial and error nature of patient treatment and to create targeted therapies." Professor Vadas explains Dr Jormakka is working in a complicated scientific field but that his work is critical to improved drug therapies.

"For Dr Jormakka the higher the degree of difficulty the more interested he becomes. He is prepared to investigate very difficult subjects and his success to date is extremely encouraging," says Professor Vadas. "We are proud to have recruited such a talented young scientist to Centenary to lead our new Structural Biology program. We look forward to further scientific advances from him and his team which will have the potential to improve outcomes for patients."